第四百零一章 目标RNA
小说：学霸的科幻世界作者：幸运的球球字数：4916更新时间 : 2020-02-22 23:49:55
庞学林顿了顿，继续道：“当初蜂巢实验室病毒泄露，我走的比较急，直接将新型病毒的样品注射到了自己的体内，也没来得及从蜂巢实验室内拷贝出新型病毒的相关基因序列，所以现在想要重新研发出那种病毒，难度比较大大，另外还有一个问题……”
“什么问题？”
“肯普滕基地实验室比较简陋，我们缺乏一些高端的实验器材和设备。比如我们现在想测定蛋白质的动态学特征，需要动态APT，就是所谓的动态原子探针层析仪，通过它，我们可以观测到蛋白质分子以及RNA分子的动态学特征。”
阿尔伯特沉吟片刻说道：“你把需要的物资列出一张清单来，我会派人帮你把这些设备全部配齐。”
庞学林脸上露出满意的笑容，说道：“阿尔伯特先生，那就麻烦你了。”
接下来，庞学林配合阿尔伯特·威斯克带来的科研人员，任由他们从自己身上采集相关血液以及生物学样本。
甚至他还叫来了艾丽丝，让她也配合保护伞公司采集样本。
如今因为庞学林的出现，艾丽丝已经不再是保护伞公司关注的重点，对于艾丽丝出现在肯普滕基地，阿尔伯特也并没有发表什么意见。
待到这些工作全部做完，阿尔伯特·威斯克婉拒了庞学林共进晚餐的邀请，急急忙忙的搭乘飞机离开。
看着保护伞公司远去的直升机，庞学林对跟在自己身旁的艾丽丝道：“艾丽丝，准备一下，等保护伞公司的设备到位以后，你去一趟希尔军事基地。”
“好！”
艾丽丝点了点头。
两天后，保护伞公司送来了动态原子探针层析仪以及各种尖端的实验仪器以及耗材。
斯普鲁斯，柏克莱，黄瑜等人看得目瞪口呆，这里面的很多实验设备都是保护伞公司独有的，外界根本见都没见过。
就连庞学林也围着那台动态原子探针层析仪看了半天，这玩意如果放到现代社会，无论对生物学还是材料学研究而言，都算是一台大杀器。
只是可惜的是，他现在主要精力放在研究如何对抗T病毒上面，压根没时间去学习APT方面的技术。
一周后，艾丽丝率领一支两百多人的精锐小队，以牺牲二十多人的代价扫荡了希尔基地，并且从希尔基地内弄到了大量的武器装备和弹药。
除了步枪、机枪、装甲车以及各种火炮外，艾丽丝竟然还带回了三架倾侧旋翼直升机。
这样一来，肯普滕基地的对外长途运输就不再只依赖于保护伞公司的机队了，对于肯普滕基地在未来的发展意义重大。
另外，艾丽丝也没让庞学林失望，竟然在希尔空军基地弄到了三枚战术核弹头。
不过艾丽丝并没有将这些核弹头运回肯普滕基地，而是藏在了距离肯普滕基地二十公里外的一处山谷内。
这件事只有庞学林、艾丽丝、克莱尔还有吉尔四人知道，这三枚核弹头当量并不大，仅相当于两万吨TNT的威力，单枚重量更是只有五十公斤左右。
庞学林提着两枚核弹在山里完全可以健步如飞。
保护伞公司的秘密基地基本上都位于地下，如果事不可为，亦或是斯宾塞在意识到庞学林一直在敷衍自己后对肯普滕基地施压，这三枚核弹头，也足以让庞学林摧毁斯宾塞的地下基地。
深夜，确定将这三枚核弹藏好后，庞学林和艾丽丝悄无声息地返回肯普滕基地。
“好了，时间也不早了，你也回去早点休息吧。”
庞学林正准备和艾丽丝告别，回自己的房间休息。
艾丽丝忽然出声道：“等等……”
“怎么了？”
庞学林转过身，看着艾丽丝道。
艾丽丝说道：“庞，我们大概什么时候才能对保护伞公司展开攻击？”
庞学林微微一愣，说道：“不是说好了，等我研发出对付T病毒的解药后，再动手吗？”
艾丽丝摇了摇头，说道：“我恐怕等不了那么久。”
“为什么？”
庞学林皱了皱眉。
艾丽丝道：“斯宾塞想要毁灭全人类，来建立属于他的超级帝国，现在距离T病毒大爆发已经过了将近一年时间了，目前全世界幸存的人类加起来，一千万都不一定有，再过上几年，恐怕我们就算干掉斯宾塞他们，地球上的人类恐怕也剩不了几个了。”
庞学林道：“那你准备怎么办？”
艾丽丝道：“一年时间，一年内，你如果能搞定T病毒的解药，那我们继续合作，如果你搞不定的话，我会带着核弹去找斯宾塞说话。”
庞学林静静地看着艾丽丝，他能感觉到对方的决心。
庞学林沉吟片刻，道：“好，那我尽力。”
艾丽丝只是淡淡地点了点头，不再说话，转身离去。
庞学林看着艾丽丝的背影，有些无奈。
他虽然将艾丽丝忽悠到肯普滕基地，双方相处了也有半年的时间，但他能感觉出来，艾丽丝并没有对自己完全的信任。
不过这也是没办法的事，庞学林到现在还与保护伞公司虚与委蛇。
要不是斯宾塞对庞学林体内的基因优化剂更感兴趣，而没再对艾丽丝下手的话，恐怕艾丽丝早就暴走了。
……
艾丽丝的这段话给了庞学林一定的压力，接下来的时间里，他将所有精力都放在了对T病毒解药的研究上面。
这下，轮到斯普鲁斯、阿什福德、柏克莱这些大佬震惊了。
庞学林之前虽然也跟着他们研究T病毒，但大部分时间他都扮演着一个助手的角色，很少会主动在学术问题上发表个人意见。
但是当他真正开始主导实验室的运行的时候，很快就展现出了一名学术大牛的实力。
实验室一共三十多人，除了庞学林、斯普鲁斯、柏克莱、黄瑜、阿什福德这几位大牛外，剩下的都是像小东北这样有一定学术背景的博士生或者研究助理。
在研究开始的前三个月。
庞学林首先让小东北他们通过冷冻电镜、原子探针层析仪、核磁共振仪等设备分析细胞内各种蛋白质以及非编码RNA的结构以及各种数据。
得到这些数据后，庞学林开始通过MOSS控制的数学方法建立蛋白质以及非编码RNA的结构与动态特征的动力学以及生物功能模型，并且让MOSS编写蛋白质与非编码RNA的模拟软件。
这项工作很繁琐，也非常复杂，但庞学林硬是凭借着自己强大的数学功底，以及量子计算机超强的计算能力完成软件的编写工作。
当他将这款软件应用到实际工作中去的时候，瞬间就把斯普鲁斯他们镇住了。
通过这款软件，科学家们可以主动构建一些全新的RNA分子以及蛋白质分子，然后通过软件模拟出这些分子的生物学功能。
结果他们很快就发现，这款软件不但模拟精度极高，甚至还可以预言一些未曾发现的蛋白质分子以及RNA分子的存在。
甚至于，庞学林利用这款软件，构建出了T病毒的生物动力学模型，完善了T病毒入侵人体的图景。
首先，T病毒通过其表面糖蛋白与宿主细胞的特异性受体结合，接着病毒囊膜与细胞浆膜（即通过不依赖于PH途径）或有酸性环境的核内体膜（PH依赖途径）融合后释放病毒核糖核蛋白复合体（RNP）至细胞浆，在转录过程中每一mRNA得以合成，而通过复制产生全长反义基因组RNA，使其作为病毒基因组RNA的模板。
新合成的RNP复合体与病毒结构蛋白在细胞浆膜或高尔基体膜组装，然后释放新合成的子代病毒。
子代病毒在细胞内生长繁殖，然后对周边的细胞发起大规模进攻。
而且，T病毒还有一个神奇的特性，它体内的RNA不仅能够利用人体正常细胞进行繁殖，甚至还可以与人体内的一些非编码RNA形成联动效应，大规模改变人体细胞的生长代谢速度。
而庞学林他们要做的，就是寻找一种能够对T病毒的RNA形成干扰的非编码RNA，从而使得T病毒陷入沉寂状态，即使感染人体，也因为基因没办法表达，从而无法在人体内大范围繁殖。
……
时间一天天流逝，不知不觉间，半年的时间转瞬即逝。
这天，庞学林刚来到实验室，负责值班的斯普鲁斯兴冲冲地找到了庞学林，大笑道：“庞教授，我们找到可以使得目标RNA了？”
“找到了，是第几组？”
庞学林眼睛一亮，有些惊喜道。
之前利用庞学林开发的那款蛋白质及RNA分子生物动力学功能模拟软件，庞学林他们编写出了一种具备使得T病毒基因陷入沉默状态的特殊RNA。
随后，他们通过对人体细胞内成千上万种RNA筛选，从中找出了两百多种RNA。
接下来，就是一组一组地实验过去。
这种工作很繁琐，基本上就是不停地重复之前的工作。
庞学林倒没有主动参与进去，他已经规划好了后续的研究路线，只等着找到目标RNA的那一天。
只是这段时间，实验室已经试验了上百种非编码RNA，始终没能达到想要的效果。
庞学林都怀疑自己之前的路是不是走错了，如果一年的约定时间到了，艾丽丝真要离开肯普滕镇，走上与保护伞公司直接对抗的道路，那庞学林真没太好的办法去阻止对方。
斯普鲁斯道：“是第112组，我们将这种RNA活性提取物注射到细胞内后，通过动态APT观察到细胞内的T病毒含量大幅度降低，甚至已经停止了RNP复合体的合成。”
庞学林点了点头，微笑道：“这是个好消息，有观察到112号非编码RNA如何实现对T病毒RNA造成基因沉默的机制吗？”
斯普鲁斯道：“我们发现，112号RNA进入细胞后，通过细胞内的RNA-蛋白质联动，可以使得组蛋白N端结构域的赖氨酸残基实现去乙酰基化加工和甲基化修饰，这一过程由甲基转移酶催化，修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰， T病毒RNA可以与经过甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质形成异染色质，在上述过程中，除了部分组蛋白的N端尾部结构域需要去乙酰化、甲基化修饰之外，有时也需要在其他的组蛋白N端尾部结构域的赖氨酸或精氨酸残基上相应地进行乙酰化修饰，这种修饰的最终结果就是T病毒相应区段的基因沉寂失去转录活性……”
庞学林沉吟片刻，说道：“把阿什福德博士、黄瑜教授、柏克莱教授他们都找来，我们召开一个闭门会议，研究一下后续的工作计划。”
“好！”
斯普鲁斯点头道。
找到目标RNA只是一个起点，接下来还有更重要的工作要做。
庞学林想要的可不止是让人类对T病毒免疫而已，他想要做的，如何利用这种目标RNA制造一种空气传播的新型病毒，这种新型病毒在人体体内基本上相当于一种无害的内源性逆转录病毒，但是在丧尸体内以及T病毒的感染者体内，却可以瞬间让他们体内的T病毒失活。
这样的话，到时候对付斯宾塞以及他的手下的时候，失去了T病毒赋予的各种超能力，那么斯宾塞他们在庞学林面前也不过是一群土鸡瓦狗而已。
这种工作，就需要阿什福德、柏克莱、黄瑜他们群策群力了。
果然，在得知找到目标RNA后，阿什福德、柏克莱他们脸上均露出了欣喜之色。
目标RNA的发现，让他们在这个黑暗的时代，看到了一缕希望的曙光。
不过利用目标RNA组装新病毒同样不是一件简单的事，庞学林和斯普鲁斯、阿什福德、柏克莱还有黄瑜讨论了整整一周的时间，才完成了目标病毒的设定。
接下来，他们便通过将这种RNA与腺病毒（AAV，前文提到过，这种病毒对人体无害，很多人体内都有，科学家们经常利用腺病毒来制造疫苗）相结合，然后利用新型的基因编辑工具，在腺病毒内添加了部分基因，使得这种新型病毒具备空气传播能力。
而到了这个时候，距离庞学林和艾丽丝的约定，只剩下不到一个月的时间了。
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“什么问题？”
“肯普滕基地实验室比较简陋，我们缺乏一些高端的实验器材和设备。比如我们现在想测定蛋白质的动态学特征，需要动态APT，就是所谓的动态原子探针层析仪，通过它，我们可以观测到蛋白质分子以及RNA分子的动态学特征。”
阿尔伯特沉吟片刻说道：“你把需要的物资列出一张清单来，我会派人帮你把这些设备全部配齐。”
庞学林脸上露出满意的笑容，说道：“阿尔伯特先生，那就麻烦你了。”
接下来，庞学林配合阿尔伯特·威斯克带来的科研人员，任由他们从自己身上采集相关血液以及生物学样本。
甚至他还叫来了艾丽丝，让她也配合保护伞公司采集样本。
如今因为庞学林的出现，艾丽丝已经不再是保护伞公司关注的重点，对于艾丽丝出现在肯普滕基地，阿尔伯特也并没有发表什么意见。
待到这些工作全部做完，阿尔伯特·威斯克婉拒了庞学林共进晚餐的邀请，急急忙忙的搭乘飞机离开。
看着保护伞公司远去的直升机，庞学林对跟在自己身旁的艾丽丝道：“艾丽丝，准备一下，等保护伞公司的设备到位以后，你去一趟希尔军事基地。”
“好！”
艾丽丝点了点头。
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斯普鲁斯，柏克莱，黄瑜等人看得目瞪口呆，这里面的很多实验设备都是保护伞公司独有的，外界根本见都没见过。
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除了步枪、机枪、装甲车以及各种火炮外，艾丽丝竟然还带回了三架倾侧旋翼直升机。
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另外，艾丽丝也没让庞学林失望，竟然在希尔空军基地弄到了三枚战术核弹头。
不过艾丽丝并没有将这些核弹头运回肯普滕基地，而是藏在了距离肯普滕基地二十公里外的一处山谷内。
这件事只有庞学林、艾丽丝、克莱尔还有吉尔四人知道，这三枚核弹头当量并不大，仅相当于两万吨TNT的威力，单枚重量更是只有五十公斤左右。
庞学林提着两枚核弹在山里完全可以健步如飞。
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深夜，确定将这三枚核弹藏好后，庞学林和艾丽丝悄无声息地返回肯普滕基地。
“好了，时间也不早了，你也回去早点休息吧。”
庞学林正准备和艾丽丝告别，回自己的房间休息。
艾丽丝忽然出声道：“等等……”
“怎么了？”
庞学林转过身，看着艾丽丝道。
艾丽丝说道：“庞，我们大概什么时候才能对保护伞公司展开攻击？”
庞学林微微一愣，说道：“不是说好了，等我研发出对付T病毒的解药后，再动手吗？”
艾丽丝摇了摇头，说道：“我恐怕等不了那么久。”
“为什么？”
庞学林皱了皱眉。
艾丽丝道：“斯宾塞想要毁灭全人类，来建立属于他的超级帝国，现在距离T病毒大爆发已经过了将近一年时间了，目前全世界幸存的人类加起来，一千万都不一定有，再过上几年，恐怕我们就算干掉斯宾塞他们，地球上的人类恐怕也剩不了几个了。”
庞学林道：“那你准备怎么办？”
艾丽丝道：“一年时间，一年内，你如果能搞定T病毒的解药，那我们继续合作，如果你搞不定的话，我会带着核弹去找斯宾塞说话。”
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艾丽丝的这段话给了庞学林一定的压力，接下来的时间里，他将所有精力都放在了对T病毒解药的研究上面。
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庞学林之前虽然也跟着他们研究T病毒，但大部分时间他都扮演着一个助手的角色，很少会主动在学术问题上发表个人意见。
但是当他真正开始主导实验室的运行的时候，很快就展现出了一名学术大牛的实力。
实验室一共三十多人，除了庞学林、斯普鲁斯、柏克莱、黄瑜、阿什福德这几位大牛外，剩下的都是像小东北这样有一定学术背景的博士生或者研究助理。
在研究开始的前三个月。
庞学林首先让小东北他们通过冷冻电镜、原子探针层析仪、核磁共振仪等设备分析细胞内各种蛋白质以及非编码RNA的结构以及各种数据。
得到这些数据后，庞学林开始通过MOSS控制的数学方法建立蛋白质以及非编码RNA的结构与动态特征的动力学以及生物功能模型，并且让MOSS编写蛋白质与非编码RNA的模拟软件。
这项工作很繁琐，也非常复杂，但庞学林硬是凭借着自己强大的数学功底，以及量子计算机超强的计算能力完成软件的编写工作。
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甚至于，庞学林利用这款软件，构建出了T病毒的生物动力学模型，完善了T病毒入侵人体的图景。
首先，T病毒通过其表面糖蛋白与宿主细胞的特异性受体结合，接着病毒囊膜与细胞浆膜（即通过不依赖于PH途径）或有酸性环境的核内体膜（PH依赖途径）融合后释放病毒核糖核蛋白复合体（RNP）至细胞浆，在转录过程中每一mRNA得以合成，而通过复制产生全长反义基因组RNA，使其作为病毒基因组RNA的模板。
新合成的RNP复合体与病毒结构蛋白在细胞浆膜或高尔基体膜组装，然后释放新合成的子代病毒。
子代病毒在细胞内生长繁殖，然后对周边的细胞发起大规模进攻。
而且，T病毒还有一个神奇的特性，它体内的RNA不仅能够利用人体正常细胞进行繁殖，甚至还可以与人体内的一些非编码RNA形成联动效应，大规模改变人体细胞的生长代谢速度。
而庞学林他们要做的，就是寻找一种能够对T病毒的RNA形成干扰的非编码RNA，从而使得T病毒陷入沉寂状态，即使感染人体，也因为基因没办法表达，从而无法在人体内大范围繁殖。
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这天，庞学林刚来到实验室，负责值班的斯普鲁斯兴冲冲地找到了庞学林，大笑道：“庞教授，我们找到可以使得目标RNA了？”
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庞学林眼睛一亮，有些惊喜道。
之前利用庞学林开发的那款蛋白质及RNA分子生物动力学功能模拟软件，庞学林他们编写出了一种具备使得T病毒基因陷入沉默状态的特殊RNA。
随后，他们通过对人体细胞内成千上万种RNA筛选，从中找出了两百多种RNA。
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庞学林倒没有主动参与进去，他已经规划好了后续的研究路线，只等着找到目标RNA的那一天。
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庞学林点了点头，微笑道：“这是个好消息，有观察到112号非编码RNA如何实现对T病毒RNA造成基因沉默的机制吗？”
斯普鲁斯道：“我们发现，112号RNA进入细胞后，通过细胞内的RNA-蛋白质联动，可以使得组蛋白N端结构域的赖氨酸残基实现去乙酰基化加工和甲基化修饰，这一过程由甲基转移酶催化，修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰， T病毒RNA可以与经过甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质形成异染色质，在上述过程中，除了部分组蛋白的N端尾部结构域需要去乙酰化、甲基化修饰之外，有时也需要在其他的组蛋白N端尾部结构域的赖氨酸或精氨酸残基上相应地进行乙酰化修饰，这种修饰的最终结果就是T病毒相应区段的基因沉寂失去转录活性……”
庞学林沉吟片刻，说道：“把阿什福德博士、黄瑜教授、柏克莱教授他们都找来，我们召开一个闭门会议，研究一下后续的工作计划。”
“好！”
斯普鲁斯点头道。
找到目标RNA只是一个起点，接下来还有更重要的工作要做。
庞学林想要的可不止是让人类对T病毒免疫而已，他想要做的，如何利用这种目标RNA制造一种空气传播的新型病毒，这种新型病毒在人体体内基本上相当于一种无害的内源性逆转录病毒，但是在丧尸体内以及T病毒的感染者体内，却可以瞬间让他们体内的T病毒失活。
这样的话，到时候对付斯宾塞以及他的手下的时候，失去了T病毒赋予的各种超能力，那么斯宾塞他们在庞学林面前也不过是一群土鸡瓦狗而已。
这种工作，就需要阿什福德、柏克莱、黄瑜他们群策群力了。
果然，在得知找到目标RNA后，阿什福德、柏克莱他们脸上均露出了欣喜之色。
目标RNA的发现，让他们在这个黑暗的时代，看到了一缕希望的曙光。
不过利用目标RNA组装新病毒同样不是一件简单的事，庞学林和斯普鲁斯、阿什福德、柏克莱还有黄瑜讨论了整整一周的时间，才完成了目标病毒的设定。
接下来，他们便通过将这种RNA与腺病毒（AAV，前文提到过，这种病毒对人体无害，很多人体内都有，科学家们经常利用腺病毒来制造疫苗）相结合，然后利用新型的基因编辑工具，在腺病毒内添加了部分基因，使得这种新型病毒具备空气传播能力。
而到了这个时候，距离庞学林和艾丽丝的约定，只剩下不到一个月的时间了。
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